Βρίσκεται στην είσοδο του χωριού, πριν από τον κυρίως οικισμό. Η θέση του ορίστηκε από εικόνα που ονειρεύτηκε και βρήκε πεζοναύτης του Ελληνικού Απελευθερωτικού Στρατού το 1912.

Αμέσως, ξεκίνησε η ανοικοδόμησή του από τους στρατιώτες και έγινε ο πρώτος ενοριακός ναός του Σιγρίου για τους έλληνες κατοίκους του χωριού, ως το 1928 που ενοριακός ναός έγινε η Αγία Τριάδα και πλέον ο Άγιος Νικόλαος είναι ο Ναός του Κοιμητηρίου.

Ως χωριό θαλασσινών το Σίγρι, ο Άγιος Νικόλαος τιμάται με ιδιαίτερη ευλάβεια.